Unifin hallituksen muodostavat puheenjohtaja, varapuheenjohtaja ja kolme muuta jäsentä. Hallitus kokoontuu lomakausia lukuun ottamatta kerran kuussa.
Unifin hallituksen kokoonpano 1.1.2024-31.12.2025:
Ilkka Niemelä
Puheenjohtaja
Rehtori
Aalto-yliopisto
Minna Martikainen
Rehtori
Vaasan yliopisto
Ingmar Björkman
Rehtori
Hanken
Jari Ojala
Rehtori
Jyväskylän yliopisto
Juha-Matti Saksa
Rehtori
LUT-yliopisto